INITIAL COMPARISON

Invalid codons removed and 3 allowed mismatches in marbox region of 20 NTs

marRAB

INI96H
PeptideCountPeptideCount
FANIAR23,836YIARKQ30,600
YIARKQ23,716WRQKST30,324
WRQKST23,287FGGAGR27,737
WPGRTS20,256FANIAR26,925
FPTLAP19,897WPGRTS22,783
INI 96h

yba0

INI96H
PeptideCountPeptideCount
YSRGRG7,762FVPSRS1,172,198
FVILLD6,824YSRGRG4,693
FPMTRA5,915FVILLD3,958
YGGGAT5,737FPMTRA3,384
CALVAR5,096YGGGAT3,094
INI 96h

rob

INI96H
PeptideCountPeptideCount
WPLGLK16,979CVAAGN380,856
WGMGGV16,701YPESAT369,831
CQVTRM16,588WQRLSR129,045
WTADAT15,537WAKRLT18,030
FGLAMV13,507WGMGGV11,493
INI 96h

acnA

INI96H
PeptideCountPeptideCount
FSHAVR10,570WPRTHP3,313,550
WPGMTD9,430WPSTHP3,912
WGLKLA8,894WPKTHP3,399
CGTEDV8,787WPMTHP2,223
CPVNAT8,284FSHAVR1,977
INI 96h

acrAB

INI96H
PeptideCountPeptideCount
FRSVAG10,715WQRQSR1,651,500
YEMIAR10,034WSRSGR15,984
WQEAGQ8,677FRSVAG5,833
CRHGGV7,244YEMIAR5,265
FKPLRN6,958WQEAGQ4,950
INI 96h

fldB

INI96H
PeptideCountPeptideCount
WGLHPR21,611WSNVRI1,150,987
WGSVPP17,922FARPKP172,287
WGLVTP15,510WQNTAD40,421
CNARIG11,741YGRMGR9,906
YMEVLM7,194CNARIG6,042
INI 96h

fldA

INI96H
PeptideCountPeptideCount
YASRNQ8,238YASRNQ8,277
YALEPH7,968YALEPH7,855
WMPPST6,301CKAATA6,482
CKAATA6,270WMPPST6,312
FTGRAS5,875FTGRAS6,285
INI 96h

fpr

INI96H
PeptideCountPeptideCount
FAGVHL10,578WQRAVR472,296
CILNLE9,758WVKPLM383,972
YMGGTR8,549WQKSSR115,868
WQENRG8,415FSILLE47,822
YLPRVL7,602FNTDRV37,241
INI 96h

hdeA

INI96H
PeptideCountPeptideCount
WPRARR33,425FKPRHV914,879
FGPLSM15,597WPRARR8,524
FASIPR10,854FGPLSM4,031
WQDVMD8,333FASIPR3,110
YRRMLE8,061WQDVMD2,756
INI 96h

mdtG

INI96H
PeptideCountPeptideCount
FNLITG12,803WDSTMT1,086,017
YKTRLV12,056WDRTMT6,424
WADMSA10,146FNLITG2,983
WPRKSI9,745WDITMT2,869
CPNREA9,480YKTRLV2,773
INI 96h

poxB

INI96H
PeptideCountPeptideCount
WNVLGD18,488WNVLGD23,957
WELAKA11,543WELAKA14,900
YMIGRL9,396YMIGRL12,020
FHTMAG8,773FHTMAG11,037
FLANGT8,263WSGGNT10,616
INI 96h

purA

INI96H
PeptideCountPeptideCount
CDVVTG9,660WGRSTR471,537
WKDASG7,388CDVVTG4,395
WPGNQE6,058WKDASG3,583
YMQSGL6,006WPGNQE2,918
CSRGML5,933CSRGML2,901
INI 96h

ribA

INI96H
PeptideCountPeptideCount
WKRTGL15,677WKRTGL5,327
WGTHMR10,602FLAPVP2,995
CGMMEP9,687WHRTRG2,889
WHRTRG9,475WVSLDG2,822
FLAPVP9,078CGMMEP2,681
INI 96h

slp

INI96H
PeptideCountPeptideCount
CVHTRK20,264WRTVTA1,337,976
YDKSPG19,850YAVDTH48,691
WMRGRE17,311YDKSPG11,816
YLPAII15,582CVHTRK11,727
WPVRQH15,410WMRGRE10,934
INI 96h

COUNTS BELLOW 1000 REMOVED

marRAB

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

yba0

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

rob

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

acnA

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

acrAB

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

fldB

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

fldA

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

fpr

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

hdeA

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

mdtG

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

poxB

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

purA

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

ribA

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

slp

INI INI above 1000 96h 96h above 1000

LOGOS BELOW 1000

marRAB

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

yba0

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

rob

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

acnA

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

acrAB

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

fldB

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

fldA

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

fpr

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

hdeA

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

mdtG

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

poxB

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

purA

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

ribA

INI INI below 1000 96h 96h below 1000

slp

INI INI below 1000 96h 96h below 1000